Gene Expression Omnibus(GEO)是一个储存高通量功能基因组学数据的数据库,这些高通量功能基因组学数据来自芯片和新一代的测序仪得到的试验数据。GEO除了收录...
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蛋白质一级二级结构 |
一级蛋白质数据库,生物数据库的链接
TrEMBL也是一个蛋白质数据库,其中包括EMBL库中的所有蛋白质编码区序列,提供了非常全面的蛋白质序列数据来源,但这不可避免地导致其注释质量的下降。 3.PIR数据库:PIR数据库的数量 ⑤UniRef:汇总几个主要UniPort数据库并删除重复序列的数据库 ⑥UniProtKB:带有详细注释的数据库并链接到其他数据库(5)初级蛋白质结构数据库 1.PDB:蛋白质
?^? 蛋白质数据库类型包括:UniProtKB、PDB、Pfam、CATH、SCOP2、KEGG和OMIM。 UniProtKB属于一级蛋白质数据库。 网址是:http://uniprot/其三级数据库:UniPrac:includesallUn1.PrimaryProteindatabase:1.Primarysequencedatabase:Swiss-Prothaslowredundancyandhighcredibility(reviewed); TrEMBL中的数据冗余度较高(未审核且自动标注);Uniprot中也有PIR;
一级蛋白质序列数据库包括Swiss-Prot、TrEMBL和PIR三大主要蛋白质序列数据库,它们共同构成了UniProt数据库。 1.Swiss-ProtSwiss-Protis手动注释蛋白质序列数据库。 1)UniPrac:包含UniProt数据库子库中的所有蛋白质序列,该子库庞大且粗糙。 2)UniRef:汇总了几个主要UniProt数据库并删除重复序列的数据库。 3)UniProtKB:详细注释和其他数据库的链接
1.1序列数据库:UniProt包含三个主要的蛋白质序列数据库,Swiss-Prot、TrEMBL和PIR,分为三个级别:第一级称为UniParc,包含了UniProt数据库子库中的所有蛋白质序列,规模较大且粗糙。 第二个层次是UniRef,它总结了Unilevel。 一级蛋白质数据库:存储通过各种科学方法获得的最直接的基础数据。 例如X射线衍射法得到的蛋白质的三级结构等。 MMDB就属于他们。 英文缩写"MMDB"常被用作
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